Чтобы установить этот ключик надо вызвать метод
PHP
LabCMS::i()->setAllowFileUpload();
или зайти на главную страницу админки, где он устанавливается автоматически.
Так что дело не в правах - просто сначала Вы попытались вызвать файловый менеджер из модуля, который этого не предусматривал, а потом сделали тоже самое, предварительно зайдя на главную страницу админки.