Главное меню
все форумы все темы форума добавить тему
Base
Почитал что пишут в сети - похоже с этой проблемой столкнулись на определенном этапе все CMS, которые поддерживают URL произвольной вложенности. Практически все в качестве решения выбрали абсолютные пути в шаблонах и JS.
Возможно, стоит последовать их примеру.