Smarty
<form action="{url action="comment_add" var1=$comments.add_id}" method="post">
<input type="hidden" value="{$_user->token}" name="token" />
Комментарий<textarea name="text"></textarea>
<input type="submit" value="Сохранить"/>
</form>это для авторизованного пользователя.
Сообщение выдается только админу и выдается тогда, когда действительно нарушена структура комментариев. Структура nested sets в этом плане более уязвима чем adjacency list. Так что придется Вам либо разобраться с ней и исправить ключи руками, либо почистить таблицы с комментариями, чтобы они создавались заново.