Старый скин больше поддерживаться не будет, так что может работать некорректно.
В ближайшей версии можно будет создавать свой скин админки на основе базового (так же как и для клиентской части). Так что пока я бы рекомендовал просто внести в него изменения, чтобы меню помещалось... Ну или вообще сделать свой модуль меню для админки.